2006年上海市普通高校招生集中录取阶段第二批本科院校录取工作自7月20日开始，于7月28日下午结束。
共有264所高校（本市25所，外省市239所）参加第二批本科院校录取，招生计划总数30530名，其中文史类8285名，理工类22245名。实际录取考生30600名，比原计划增招70名，完成计划的100.23%。其中文史类录取8266名，减招19名，理工类录取22334名，增招89名。本市院校录取26516名，增招589名；外省市院校录取4084名，减招519名。未完成招生计划的多数是独立设置的二级学院和一些收费较高的中外合作办学专业。
从二本录取的总体情况看，上海地区院校生源继续看好，全部完成招生计划，录取考生的成绩也较高，但收费较高的专业生源欠佳，部分专业补填志愿后才完成招生计划。外省市院校在沪招生计划完成情况明显好于往年，但一些边远地区的院校，由于生源情况不够理想，没有完成招生计划。
  7月25日至26日，二本线上未录取考生补填志愿。文科共有1340名考生补填了志愿，占可补填考生数的94.77%，理科共有3192名考生补填志愿，占可补填考生数的78.47%。
  第二批本科招生院校录取通知书从7月28日起由招生院校陆续通过邮政发出。由于路程关系和全国各地录取时间的不同步，被外省市院校录取考生的通知书可能要晚些时候才能收到，考生可通过登录“上海招考热线”，或拨打16886337声讯电话，查询外省市院校的录取结果。
  参加第三批高职高专招生的有55所本市院校（含本市提前批专科院校）和123所外省市院校，计划招生31653名，其中文史类招生13557名，理工类招生18096名；本市院校招生29916名，外省市院校招生1737名。
根据工作日程，7月28日，本市第三批高职高专艺术体育类专业录取工作开始。7月29日至31日，考生进行第二次志愿填报（不含艺术体育类和军事公安类高职高专），8月3日，根据第三批招生计划数与志愿填报人数，上海市教育考试院将确定并公布第三批高职高专最低录取控制分数线。8月3日，第三批高职高专（不含艺术体育类和军事公安类）提前批录取工作开始。......